事业单位合同制度是指以员工个人为依据，与单位签订的一种聘用制度，相对于传统的编制制度，合同制度相对灵活，适应性更强。这种制度近年来被越来越多的事业单位采用，在其实际实施中，也出现了一些优点和缺点。
优点方面，一是有利于调动工作积极性和主动性，逐步建立绩效考核体系，提高职工的生产力和工作效益。二是提高了事业单位管理效率。三是缩小了事业单位与市场和竞争之间的距离，使得事业单位更具亲和力。缺点方面，一是可能会出现岗位不稳定的问题，二是法制化程度不高，三是可能导致事业单位聘用更多的非全日制人员。
这就是目前国内事业单位合同制度的一些优点和缺点，事业单位在采用这种制度时，应注重制度的完善和具体实施，以避免出现各种问题。